La Fondation Hirondelle est intervenue au Timor-Leste entre 2001 et 2006, d’abord en créant un programme radiophonique destiné aux réfugiés, « Moris Hamutuk » (« vivre-ensemble »), diffusé par la radio de la mission des Nations Unies au Timor-oriental. Puis à partir de 2002, suite à une demande du chef de l’Administration provisoire des Nations Unies au Timor Oriental, Sergio Vieira de Mello, la Fondation Hirondelle assure un programme de transformation de la radio onusienne en radio et télévision de service public pour le pays qui venait d’acquérir son indépendance.
La Fondation Hirondelle soumet en décembre 1999 à la Mission des Nations Unies au Timor oriental (Timor-Leste), l’UNTAET, l’idée d’une radio destinée aux réfugiés. C’est finalement en septembre 2001 que l’UNTAET et la Fondation Hirondelle s’accordent pour lancer, sur les ondes de la Radio de la mission des Nations Unies, une heure quotidienne de programmes destinée spécifiquement aux réfugiés. Les journalistes de la Fondation Hirondelle peuvent en effet se déplacer dans la partie ouest de l’île, contrairement à ceux employés par les Nations Unies qui seraient en dehors de leur juridiction.
Ce programme s’appellera « Moris Hamutuk », ce qui veut dire, en Tetum, la langue du pays, « vivre ensemble ». Le programme sera aussi réalisé en Bahasa d’Indonésie et parfois dans des dialectes plus locaux. Il vise à informer les habitants du Timor-Leste sur ce que vivent les réfugiés de l’autre côté, à Timor-Ouest, parmi lesquels se trouvent aussi des chefs de guerre, et inversement de mieux informer la population de réfugiés sur ce qui se passe à Timor-Leste. Le programme emploie six journalistes de Timor-Leste, un administrateur, un technicien et des interprètes. Trois journalistes de Timor-Ouest collaborent aussi à temps partiel à ce programme, pour des reportages, notamment, à l’intérieur des camps. Pour obtenir une couverture la plus large possible de l’île, la Fondation Hirondelle a également amélioré le dispositif de diffusion de Radio UNTAET, notamment par l’installation d’un émetteur au sommet de la montagne Kutalaut.
Au printemps 2002, au moment où l’UNTAET quitte Timor, Sergio Vieira de Mello, chef de l’Administration provisoire des Nations Unies au Timor Oriental de novembre 1999 à mai 2002, propose à la Fondation Hirondelle d’assurer la transition entre Radio UNTAET et la future Radio Télévision de Timor-Leste, la RTTL. La Fondation Hirondelle mènera ce projet à bien jusqu’à fin 2006. Le financement est assuré par la Direction du Développement et de la Coopération suisse et par l’Agence des États-Unis pour le développement international (USAID).
La Fondation Hirondelle reprend, au moment du départ des Nations Unies, la gestion de la radio et de la télévision, qui sera progressivement transférée à l’entité nationale. Mais l’essentiel du travail consistera à accompagner la formulation de la loi sur le service public, à former les cadres de la nouvelle entité, à perfectionner le personnel de la RTTL dans les domaines du journalisme, de la production de programmes, des finances et de l’administration. Les studios ont été modernisés. La Fondation Hirondelle a ainsi réussi le transfert d’un média d’une mission des Nations Unies à un radiodiffuseur national de service public.